根据《民办非企业单位年度检查办法》第六条，民办非企业单位年检的主要内容包括：遵守法律法规和国家政策情况；登记事项变动及履行登记手续情况；按照章程开展活动情况；财务状况、资金来源和使用情况；机构变动和人员聘用情况；其他需要检查的情况。